Oberon is recent gestart met een aantal projecten rondom onderwijssegregatie. Waar dit onderwerp een decennium geleden vooral in het teken stond van zwarte en witte-scholen (segregatie naar migratie-achtergrond) is er recent meer aandacht voor het perspectief van sociale-economische verschillen tussen van gezinnen waaruit leerlingen komen.
Het funderend onderwijs is weliswaar bij uitstek de plaats waar leerlingen van diverse thuissituaties elkaar kunnen ontmoeten, maar dat gebeurt niet automatisch: woonsegregatie, de vrije schoolkeuze en toelatingsbeleid zorgen (nog steeds) voor verschillen in de mate waarin leerlingen gemengd naar school (kunne) gaan. Oberon doet zowel op landelijk als lokaal niveau onderzoek hiernaar.
